Năm 1901, Nimule là căn cứ cho một cuộc chiến của người Anh chống lại người Lango, vốn đã đánh phá các quận lân cận. Mặc dù được quân khởi nghĩa Sudan hỗ trợ, những người Lango đã bị quân Anh bắt hoặc giết.[3]

Vào ngày 19 tháng 8 năm 2013, Quốc hội Nam Sudan quyết định nâng cấp thị trấn Nimule lên hạng thành phố, do Thư ký Thành phố quản lý. Một số người trong quận đã phản đối, kêu gọi tham vấn rộng rãi hơn.[4]

Vào ngày 7 tháng 4 năm 2014, Ngân hàng Thương mại và Phát triển Miền núi bắt đầu hoạt động tại bang Đông Equatoria bằng việc mở một chi nhánh mới tại thành phố Nimule.[5]

Ngày 6 tháng 10 năm 2017, Uganda đã cam kết cung cấp điện cho hai đô thị biên giới của Nam Sudan như một phần của thỏa thuận Nhóm nguồn điện Đông Phi; điều đó kêu gọi tất cả các quốc gia thành viên kết nối điện với nhau. Bộ trưởng Năng lượng Uganda Simon D'Ujanga cho biết "400 kilovolt điện sẽ được cung cấp cho các đô thị Kaya và Nimule để thúc đẩy các hoạt động kinh tế xã hội trong vùng này."[6]